رئیس سازمان در چهارچوب قوانین و مقررات، کلیه وظایف و اختیارات اداره سازمان از جمله موارد زیر را بر عهده دارد:

1 ـ اجرای مصوبات شورای سازمان.

2 ـ عقد قرارداد با سرمایه گذاران و یا صدور انواع گواهی ها از قبیل گواهی صرفه جویی و گواهی عدم مصرف سوخت.

3 ـ پیشنهاد اعضای هیئت مدیره صندوق به رئیس هیئت امنای صندوق جهت انتصاب.

4 ـ تدوین برنامه و بودجه سازمان و صندوق و ارائه به شورای سازمان.

5 ـ تدوین ساختار و تشکیلات سازمان و صندوق و ارائه به شورای سازمان.

6 ـ اتخاذ تصمیم نسبت به جذب، انتصاب و ارتقای سرمایه انسانی و تعیین حقوق، مزایا و پاداش مبتنی بر شایستگی ها و عملکرد آن ها.

7 ـ پیگیری و اقدام در راستای مشارکت و همکاری با سایر دستگاه های اجرایی و مؤسسات و شرکت های واجد صلاحیت فنی و مالی در چهارچوب وظایف سازمان.

8 ـ افتتاح حساب و پرداخت و دریافت وجوه نزد بانک ها و مؤسسات مالی کشور.

9 ـ انعقاد انواع عقود و معاملات، از جمله قراردادهای خرید خدمات از بخش تعاونی، خصوصی و نهادها و موسسات عمومی غیردولتی و افراد حقیقی واجد صلاحیت در چهارچوب وظایف سازمان به استناد مواد فصل دوم قانون مدیریت خدمات کشوری مصوب 1386 با اصلاحات بعدی.

10 ـ امضای کلیه اسناد و اوراق تعهدآور، اسناد مالی، اداری و مکاتبات سازمان.

11 ـ ارائه گزارش عملکرد از تحقق اهداف و اجرای وظایف سازمان به هیئت وزیران، شورای سازمان، نهادهای نظارتی و مردم.

12 ـ نمایندگی سازمان در کلیه مراجع اداری و قضایی با حق توکیل به افراد موثق و امین برای استیفای حقوق سازمان. وکیل باید با رعایت شرایط اسلام، ایمان، تخصص، وثاقت و امانت انتخاب شود.

13 ـ استفاده از ظرفیت مطالعات و پژوهش های کاربردی مراکز علمی، تحقیقاتی و مشاوره ای در راستای تحقق اهداف سازمان.

14 ـ مسئولیت کلی اداره امور سازمان، هدایت، ارزیابی و نظارت بر حسن اجرای فعالیت های سازمان. تبصره ـ رئیس سازمان می تواند با مسئو لیت خود قسمتی از اختیارات و و ظایف خود را به هر یک از مدیران ارشد سازمان که واجد شرایط اسلام، ایمان، تخصص، وثاقت و امانت می باشد تفویض نماید. تفویض اختیارات مزبور نافی مسئولیت های نهایی و پاسخگویی رئیس سازمان به مراجع ذی صلاح نمی باشد.