اهداف و ماموریت های مجتمع عبارتند از

الف ـ پیشگیری از بروز جرائم و مفاسد اقتصادی؛

ب ـ همکاری با نهادهای ذیربط جهت اصلاح ساختارهای فسادزا و تحقق شفافیت در فعالیت های اقتصادی؛

پ ـ ایجاد تمرکز و ساختار متناسب در دادگستری در جهت مبارزه با مفاسد و جرائم اقتصادی؛

ت ـ اتخاذ سیاست کیفری متناسب و برخوردار از سرعت، دقت و بازدارندگی در رسیدگی بـه جرائم اقتصادی؛

ث ـ ارتقاء کارآمدی و تقویت ارتباط و تعامل فی مابین مرجع قضایی و ضابطان در رسیدگی بـه پرونده های مربوط؛

ج ـ ایجاد زمینه برای اطلاع رسانی مناسب در جهت اقناع افکار عمومی.