شورای عالی دارای وظائف و اختیارات زیر است:

الف ـ تصویب بودجه و مقررات استخدامی سازمان.

ب ـ تعیین محدودیتها و ممنوعیت های زمانی و مکانی شکار و صید و حدود پارک های ملی و مناطق حفاظت شده و قرقهای اختصاصی.

پ ـ تعیین انواع اسلحه و وسائل ممنوع شکار و صید.

ت ـ تعیین انواع جانوران وحشی و حیوانات حمایت شده حفاظت شده و در معرض خطر انقراض و جانوران زیان کار.

ث ـ تعیین انواع پروانه ها و مدت اعتبار هر یک.

ج ـ تعیین بهای پروانه های شکار و صید که بر حسب نوع و منطقه از سیصد ریال کمتر و از سی هزار ریال بیشتر نخواهد بود بر حسب نوع و منطقه شکار و صید.

چ ـ تعیین بهای جانوران وحشی از لحاظ مطالبه ضرر و زیان.