دبیرخانه در وزارت امور اقتصادی و دارایی تشکیل می شود و عهده دار وظایف زیر خواهد بود:

1 ـ انجام امور اداری مربوط بـه تشکیل جلسات شورا، ابلاغ و پیگیری مصوبات

2 ـ حضور فعال در مجامع بین المللی و تشریح اقدامات کشور در مبارزه با پولشویی

3 ـ پیگیری اجرا و اخذ گزارش عملکرد اشخاص مشمول، نظارت و بازرسی (دوره ای، اتفاقی و موردی) از اشخاص مشمول بـه منظور اطمینان از اجرای آیین نامه ها و دستورالعمل های مصوب در حوزه مسئولیت اشخاص مشمول و مشاغل غیر مالی مشمول و تهیه گزارش اجرای قانون و مقررات مربوط هر شش ماه یک بار و ارسال بـه شورا.

4 ـ رتبه بندی سالانه اشخاص مشمول در مورد میزان رعایت مقررات مربوط بـه پولشویی و در صورت تصویب شورا، اعلام عمومی آن.

5 ـ پاسخگویی بـه مراجع ذیصلاح، اعلام مواضع، تبلیغات، پشتیبانی از دیدارگاه الکترونیک دبیرخانه و توجیه عمومی مردم با هماهنگی مراجع مسئول.

6 ـ هماهنگی در تشکیل دوره های آموزشی در داخل و خارج کشور و تدوین و انتشار جزوات آموزشی.

7 ـ برنامه ریزی سالانه اجرای قانون و آیین نامه های ذی ربط توسط مجریان و اشخاص مشمول.

8 ـ حمایت مادی و معنوی از اشخاص مشمول و کارکنان ذی ربط کـه در راستای انجام وظایف خود در اجرای مقررات مبارزه با پولشویی مورد شکایت و تعرض ارباب رجوع قرار گیرند.

9 ـ بـه روز رسانی آیین نامه ها و دستورالعمل های ذی ربط از طریق مراجع قانونی.

10 ـ تهیه پیش نویس آیین نامه های لازم و اعلام نظر در مورد دستورالعمل های پیشنهادی اشخاص مشمول.

11 ـ اعلام راه ها و فرآیندهای جدید پولشویی و تأمین مالی تروریسم در کشور و پیشنهاد اصلاح آیین نامه ها و دستورالعمل ها در صورت نیاز.